De façon générale, depuis le début du 20^ème siècle, les écosystèmes comprenant le genévrier maritime ont été pratiquement détruits ou profondément altérés. Selon le temps et l'endroit, les facteurs qui eurent une influence dans ce processus, conjointement ou séparément, furent les suivants: développement urbain, coupe non contrôlée, cultures, reboisement avec des pins, invasion par des espèces exotiques et la construction de différents types d'infrastructures.

Dans la région de Valencia, le genévrier maritime est l'une des espèces botaniques les plus menacées et elle est protégée par la législation européenne, nationale et régionale. Le genévrier pousse exclusivement le long des côtes, et celles-ci ont été intensivement urbanisées.

Dans La Devesa de l'Albufera de Valencia, les menaces et les causes principales qui ont provoqué la régression de ces espèces sont:

La régression de l'habitat. Provoqué par les transformations urbaines des années 60 et 70 et par le fait que le sable des sédiments des fleuves est retenu par les barrages ou par les grands brise-lames situés le long de la côte. Normalement, la nature emploierait ce sable pour la croissance et l'entretien de La Devesa.

1. Les feux de forêt. Ceux-ci ont lieu principalement pendant l'été.

2. La transformation des habitats dunaires. Causée par les transformations urbaines des années 60 et 70, qui sont responsables de la dévastation des crêtes dunaires et de la construction de plusieurs infrastructures.

3. Fragmentation de l'habitat. Les quelques zones où le genévrier peut encore survivre sont dispersées et situées dans des endroits qui ne sont pas favorables.

4. Disproportion entre le nombre d'arbres de chaque sexe. A l’heure actuelle, seulement 25% des arbres sont femelles.

5. Population sauvage réduite. Actuellement, la population naturelle est réduite à 52 arbres. Ceci implique un appauvrissement génétique de l’espèce qui pourraient signifier son extinction dans le secteur.

6. L'effet de maresía. Lorsque les crêtes de dunes furent aplaties pendant les années 70, les agents atmosphériques pollueurs présents dans l’eau de mer vaporisée affectèrent directement la végétation. Les arbres souffrant de cet effet de maresía sont dans un état moins sain. Ceci a répercussions sur leur croissance et sur la production des graines, certainement dû au fait qu'ils sont plus vulnérables à attraper des maladies qui peuvent également entraîner leur mort.

D’autre part, quand une forêt de genévrier est réduite, les mammifères qui dispersent leurs graines (renards, blaireaux) manquent de pâturages et leur population diminue. Ceci a un double effet. D'une part, les graines de genévrier sont plus difficilement dispersées, et d'autre part, quand ces carnivores disparaissent, les lapins, responsables de la destruction de grandes quantités de graines de genévrier et de petits arbres, commencent à proliférer.